Федеральное государственное бюджетное учреждение здравоохранения "Сибирский окружной медицинский центр Федерального медико-биологического агентства" (ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России) создано в 1926 году. ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России современная медицинская организация, оказывающая первичную медико-санитарную, специализированную, в том числе высокотехнологичную, медицинскую помощь прикрепленному контингенту.

В 2012-2013 году на базе стационара ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России начал работать консультативно-диагностический центр, оформлены бессрочные лицензии на все ранее осуществляемые виды медицинской деятельности, и на новые виды – консультативно-диагностический центр стационара, онкологию (в т.ч. высокотехнологичную), паллиативную онкологию, медицинскую реабилитацию, наркологию, профпатологию.

ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России работает в системе обязательного медицинского страхования, выполняет государственное задание по оказанию медицинской помощи, государственных услуг/работ за счет средств федерального бюджета по высокотехнологичной медицинской помощи (по профилям: абдоминальная хирургия, онкология, урология, гинекология, оториноларингология). В стационаре ежегодно получают медицинскую помощь более 5 тыс. пациентов, по поликлинике выполняется более 150 тыс. врачебных посещений в год.

В ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России внедрена и несколько лет работает медицинская информационная система «Медиалог», позволившая систематизировать и привести к единому образцу большинство медицинских процессов в учреждении. Одним из результатов внедрения медицинской информационной системы «Медиалог» стал максимально возможный отказ от бумажных носителей, в частности, использование в стационаре электронных историй болезни, а в поликлинике электронных амбулаторных карт.

ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России единственная из медицинских организаций Новосибирской области включенная в Пилотный проект Фонда социального страхования РФ «Электронный листок нетрудоспособности», в котором принимает участие 17 регионов Российской Федерации. Решающим для включения ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России в Пилотный проект стала высокая оснащенность учреждения компьютерной техникой и оборудованием, накопленный опыт работы в медицинской информационной системе. Также ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России единственное учреждение из ведомственных медицинских организаций, включенных в систему Единой городской электронной регистратуры.

В ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России постоянно ведется работа по повышению качества оказываемой медицинской помощи. Во всех структурных подразделениях медицинская помощь осуществляется в соответствии со стандартами и порядками оказания медицинской помощи. По инициативе Совета медицинских сестер были подготовлены стандарты и технологии практической деятельности медицинских сестер, которые в значительной степени позволили повысить качество ухода за больными.

С 2010 года ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России имеет Сертификат соответствия системы менеджмента качества требованиям ГОСТ ИСО 9001-2011 (ИСО 9001:2011), с 2011 года - «Свидетельство на право проведения клинических исследований лекарственных препаратов».

Активная инновационная деятельность, в т.ч. информатизация учреждения, меры, принимаемые по повышению качества медицинской помощи населению, способствовали тому, что ФГБУЗ СОМЦ ФМБА России стала одной из лучших медицинских организаций Новосибирской области и за последние 5 лет удостоена 8 больших и 3 малых "Золотых медалей" международной выставки ITE «Сибирская ярмарка» (г. Новосибирск) за развитие современных медицинских технологий и активную издательскую деятельность.